这是我的 Hugo 博客的第一篇文章。
一、与“肽 / 蛋白质”相关的基础名词
1. 氨基酸（Amino acids）
- 蛋白质和肽的基本组成单位
- 可以理解为“生物分子里的积木”
- 不同氨基酸的排列顺序决定了肽/蛋白的功能
2. 肽（Peptide）
- 由少量氨基酸连接而成的分子
- 比蛋白质短（蛋白质通常更长、更复杂）
- 本文重点研究的是具有抗病毒作用的肽
3. 蛋白质（Protein）
- 由大量氨基酸构成的功能分子
- 在细胞中承担结构、催化、调控等多种功能
- 病毒复制、入侵细胞都离不开特定蛋白
4. 一级结构（Primary sequence / Primary structure）
- 指氨基酸从头到尾的排列顺序
- 这是机器学习模型最常用的输入信息
- 就像一句话的“字母顺序”
二、抗病毒肽与抗菌肽
5. 抗菌肽（Antimicrobial Peptides, AMPs）
- 生物体天然产生的防御性小分子
- 能杀死或抑制细菌、真菌、病毒等
- 是先天免疫系统的一部分
6. 抗病毒肽（Antiviral Peptides, AVPs）
-
抗菌肽的一种特殊子类
-
专门针对病毒发挥作用
-
可以：
- 直接破坏病毒
- 阻止病毒进入细胞
- 抑制病毒复制
7. 广谱抗病毒（Broad-spectrum activity）
- 指一种肽对多种不同病毒都有效
- 在病毒变异频繁的情况下非常重要
三、病毒生命周期相关名词（图 1 中重点）
8. 病毒复制周期（Viral replication cycle）
病毒感染细胞的一整套过程，包括：
- 吸附（Adsorption）：病毒附着在细胞表面
- 融合（Fusion）：病毒膜与细胞膜融合
- 脱壳（Uncoating）：释放病毒遗传物质
- 复制（Replication）：复制病毒基因
- 转录（Transcription）：产生病毒RNA
- 翻译（Translation）：合成病毒蛋白
- 装配（Assembly）：组装新病毒
- 释放（Release）：新病毒离开细胞
👉 抗病毒肽可以在多个步骤“卡住”病毒
9. 病毒结构蛋白（Viral structural proteins）
- 构成病毒外壳或包膜的蛋白
- 一些AVPs可以直接破坏这些蛋白
10. 宿主细胞（Host cell）
- 被病毒感染的细胞（如人体细胞）
- 有些抗病毒药不是攻击病毒，而是作用于宿主细胞
四、肽的理化性质（文章反复出现）
11. 阳离子（Cationic）
- 带正电荷
- 病毒和细胞膜通常带负电
- 正负电吸引 → 有利于肽与病毒结合
12. 两亲性（Amphipathic）
-
同时具有：
- 亲水部分（喜欢水）
- 疏水部分（喜欢脂质）
-
这使肽能插入病毒膜或细胞膜
13. 疏水性（Hydrophobicity）
- 分子“怕水”的程度
- 影响肽是否能穿过生物膜
14. 净电荷（Net charge）
- 所有正负电荷的总和
- 抗病毒肽通常带正电
五、免疫与生物防御相关
15. 先天免疫（Innate immunity）
- 人和动物出生就具备的免疫防御
- 不依赖“记忆”
- 抗菌肽/抗病毒肽属于这一系统
16. 免疫原性（Immunogenicity）
- 分子是否会引起免疫系统强烈反应
- 药物免疫原性过强 → 可能有副作用
17. 细胞因子（Cytokines）
- 免疫细胞释放的信号分子
- 部分抗病毒肽可通过调节细胞因子增强免疫
六、药物相关概念
18. 半衰期（Half-life）
- 药物在体内浓度减少一半所需时间
- 肽类药物通常半衰期较短
19. 蛋白酶（Protease）
- 分解蛋白质/肽的酶
- 会导致抗病毒肽被快速降解
20. 肽环化（Peptide cyclization）
-
把线性肽“首尾连起来”
-
优点：
- 更稳定
- 不易被蛋白酶降解
- 活性更强
21. IC₅₀（半数抑制浓度）
- 表示抑制病毒活性所需的肽浓度
- 数值越小 → 抗病毒能力越强